هر قسمت این برنامه دارای بخش‌های گوناگونی است که بخش اول آن انجام یک آزمایش علمی توسط ناخدا و ملوان است. در بخش دوم یکی از کودکان پُرکار میهن‌مان دربارۀ آزمایش علمی خود که قبلاً انجام داده و با آن آزمایش در مسابقات علمی شرکت کرده توضیح می‌دهد. سپس ناخدا و ملوان آزمایش علمی او را بررسی و توضیحات تکمیل کننده‌ای به ما می‌دهند. در بخش آخر نیز اطلاعات جالب و علمی دربارۀ یکی از حیوانات حیات وحش در اختیار ما قرار می‌دهند.
فصل اول مجموعۀ «جزیره دانش» به سفارش مرکز اوج کودک و نوجوان تولید شده و راه و روش تحقیق و پژوهش را به ما آموزش می‌دهد.